Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ALCAMQ13740 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALCAMQ13740 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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