Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP1A4Q13733 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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