Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CUL1Q13616 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CUL1Q13616 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms