Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PWP1Q13610 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PWP1Q13610 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms