Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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MKRN4PQ13434 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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MKRN4PQ13434 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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MKRN4PQ13434 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN4PQ13434 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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MKRN4PQ13434 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
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MKRN4PQ13434 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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MKRN4PQ13434 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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MKRN4PQ13434 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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MKRN4PQ13434 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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MKRN4PQ13434 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MKRN4PQ13434 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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