Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NR1H3Q13133 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
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