Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RESTQ13127 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RESTQ13127 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RESTQ13127 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RESTQ13127 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RESTQ13127 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RESTQ13127 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RESTQ13127 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RESTQ13127 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RESTQ13127 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RESTQ13127 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RESTQ13127 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RESTQ13127 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RESTQ13127 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RESTQ13127 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RESTQ13127 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RESTQ13127 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RESTQ13127 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RESTQ13127 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RESTQ13127 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RESTQ13127 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RESTQ13127 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms