Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC16Q13042 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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