Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTP4A2Q12974 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTP4A2Q12974 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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