Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ANK3Q12955 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ANK3Q12955 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms