Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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FOXD4Q12950 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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FOXD4Q12950 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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FOXD4Q12950 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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FOXD4Q12950 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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FOXD4Q12950 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXD4Q12950 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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