Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFIAQ12857 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFIAQ12857 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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