Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXO1Q12778 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXO1Q12778 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms