Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMOD3Q0VAK6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMOD3Q0VAK6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms