Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY1Q0D2K3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms