Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD47Q08722 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD47Q08722 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD47Q08722 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD47Q08722 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD47Q08722 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms