Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP4F3Q08477 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F3Q08477 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms