Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TGM3Q08188 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms