Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPB1Q06547 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms