Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTDSPL2Q05D32 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms