Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP1Q04837 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP1Q04837 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms