Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBXN1Q04323 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms