Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MYBPC1Q00872 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms