Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSF1Q00613 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms