Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SIM1P81133 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SIM1P81133 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIM1P81133 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIM1P81133 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms