Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX6P78412 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX6P78412 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX6P78412 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX6P78412 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX6P78412 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX6P78412 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX6P78412 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX6P78412 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX6P78412 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX6P78412 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms