Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX1P78337 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PITX1P78337 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PITX1P78337 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITX1P78337 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITX1P78337 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITX1P78337 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITX1P78337 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms