Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNB1P62873 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNB1P62873 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNB1P62873 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GNB1P62873 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GNB1P62873 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms