Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERV-K104P61576 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms