Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVK11-1P61568 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms