Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHBDL3P58872 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms