Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CABP4P57796 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CABP4P57796 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABP4P57796 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABP4P57796 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CABP4P57796 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABP4P57796 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABP4P57796 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABP4P57796 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CABP4P57796 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CABP4P57796 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CABP4P57796 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CABP4P57796 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms