Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FBXW4P57775 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FBXW4P57775 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms