Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EEFSECP57772 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms