Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIPPLY3P57055 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms