Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BACE1P56817 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BACE1P56817 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BACE1P56817 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BACE1P56817 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BACE1P56817 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BACE1P56817 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BACE1P56817 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BACE1P56817 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BACE1P56817 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BACE1P56817 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BACE1P56817 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BACE1P56817 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BACE1P56817 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BACE1P56817 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms