Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EFNA3P52797 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA3P52797 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms