Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCR4P51679 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCR4P51679 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms