Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC3P51654 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC3P51654 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC3P51654 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC3P51654 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC3P51654 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GPC3P51654 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms