Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT4P50991 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT4P50991 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT4P50991 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT4P50991 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT4P50991 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT4P50991 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT4P50991 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCT4P50991 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCT4P50991 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCT4P50991 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT4P50991 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms