Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRIM1P49642 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms