Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ALDH9A1P49189 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALDH9A1P49189 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms