Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PITPNBP48739 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms