Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PIK3CBP42338 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PIK3CBP42338 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms