Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTR1BP42025 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms