Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXLNAP40222 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TXLNAP40222 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms