Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GGCXP38435 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GGCXP38435 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GGCXP38435 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GGCXP38435 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms