Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TGFBR1P36897 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms