Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ABCD1P33897 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms