Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXC13P31276 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXC13P31276 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms